VennDiagram各区域信息提取的示例分析

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VennDiagram是进行Venn图绘制的 R包，最多能够绘制五组数据，其中一个主要的绘图函数为venn.diagram()

针对该参数相关的参数调整，可以直接对Venn图的颜色字体等多主题进行修改。而其绘图数据，也就是venn.diagram() 对应的数据是一个list向量，

数据的读取和整理可以参考：

R语言绘制维恩图空值NA处理：https://www..com/article/259 数据读取方式，

1、譬如经相似读取数据和处理之后，获取一个向量xList，数据基本情况如下：

summary(xList)        Length Class  Mode     AT_4000 4000   -none- characterAT_3892 3892   -none- characterAT_3593 3593   -none- characterAT_3000 3000   -none- characterAT_2987 2987   -none- character

一共五组数据，各组数据如上所示，venn.diagram()绘图：

venn.plot =venn.diagram(xList,filename = NULL)grid.newpage()grid.draw(venn.plot)

之后基于相关代码调整即可。

2 如何获取各区域信息是绘制Venn图的一个关键问题

可以基于VennDiagram提供的计算函数 calculate.overlap 或者get.venn.partitions

以前者为例：

area=calculate.overlap(xList)> typeof(area)[1] "list"> summary(area)    Length Class  Mode     a31 220    -none- charactera30 286    -none- charactera29 285    -none- charactera28 175    -none- charactera27 178    -none- charactera26 149    -none- charactera25 136    -none- charactera24 206    -none- charactera23 232    -none- charactera22 356    -none- charactera21 217    -none- charactera20 284    -none- charactera19 255    -none- charactera18 147    -none- charactera17 204    -none- charactera16 131    -none- charactera15 123    -none- charactera14 213    -none- charactera13 187    -none- charactera12 300    -none- charactera11 278    -none- charactera10 216    -none- charactera9  392    -none- charactera8  209    -none- charactera7  204    -none- charactera6  153    -none- charactera5  165    -none- charactera4  153    -none- charactera3  211    -none- charactera2  224    -none- charactera1  273    -none- character

如上结果显示 五组一共获得31各区域的数据，可以利用返回的list提取每一个区域的结果，譬如取出a1区域（共273）的前10个：

> area$a1[1:10] [1] "AT3G27960" "AT4G12170" "AT1G58270" "AT3G55290" "AT1G27360" "AT2G02790" "AT1G42990" "AT3G25011" [9] "AT2G24617" "AT5G55910"

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