怎么使用命令行运行R语言的rmd rmarkdwon文件

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太长不看:

运行下面命令:

R -e "rmarkdown::render('script.Rmd',output_file='output.html')"

命令解析:

• 首先使用R -e进行R语言命令行运行, 命令用双引号包括.

• 使用rarkdown的render函数, 进行Rmd文件的运行和解析, 参数outputfile是输出文件名称和格式, 这里的格式为html, 可以选择pdf或者word格式.
  

• 需要准备的文件是script.Rmd文件, 里面是rmarkdwon的格式文件.
  

例子

文件: script.Rmd

### 我是谁?> dengfei
### 来干嘛> 演示如何通过命令行调用rmarkdwon脚本,并生产html
### 来个例子
    ```{r}    example(plot)    ```

运行:

R version 3.5.1 (2018-07-02) -- "Feather Spray"Copyright (C) 2018 The R Foundation for Statistical ComputingPlatform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Default CRAN mirror snapshot taken on 2018-08-01.See: https://mran.microsoft.com/.
> rmarkdown::render('script.Rmd',output_file='output.html')
...processing file: script.Rmd  |................................                                 |  50%  ordinary text without R code......

结果中, 将Rmd文件中的markdwon语法进行了转化, 比如"###"变为了标题. ">"变为了引用, Rmarkdown还有一个优势, 其能够将执行R代码, 然后将结果保存为markdown的格式, 其它标准markdown不具备这种能力.

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