Pacbio Sequel下机数据的示例分析

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Pacbio Sequel 下机数据介绍

Pacbio Sequel 下机数据， 一般包括如下几个数据：

m54134_180724_220656.scraps.bamm54134_180724_220656.subreads.bamm54134_180724_220656.scraps.bam.pbim54134_180724_220656.subreads.bam.pbim54134_180724_220656.baz2bam_1.logm54134_180724_220656.sts.xmlm54134_180724_220656.subreadset.xmlm54134_180724_220656.transferdonem54134_180724_220656.adapters.fasta

文件的名称是有固定的编码形式的，以上面的数据为例：

m54134_180724_220656.subreads.bam
其中：

m: 是movie 的缩写

54134： 是设备的编号

180724_220656： 是测序运行的开始时间，为2018年07月24日22时06分56秒

subreads: 这部分是不同的数据类型，一般有scraps， subreads等

bam: 这是数据的格式，一般有bam格式，xml，fasta格式等

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