千家信息网

blast如何批量注释输出结果指定需要的列信息

发表于:2026-11-03 作者:千家信息网编辑
千家信息网最后更新 2026年11月03日,今天小编给大家分享一下blast如何批量注释输出结果指定需要的列信息的相关知识点,内容详细,逻辑清晰,相信大部分人都还太了解这方面的知识,所以分享这篇文章给大家参考一下,希望大家阅读完这篇文章后有所收
千家信息网最后更新 2026年11月03日blast如何批量注释输出结果指定需要的列信息

今天小编给大家分享一下blast如何批量注释输出结果指定需要的列信息的相关知识点,内容详细,逻辑清晰,相信大部分人都还太了解这方面的知识,所以分享这篇文章给大家参考一下,希望大家阅读完这篇文章后有所收获,下面我们一起来了解一下吧。

blast批量注释输出结果指定需要的列信息

makeblastdb -in PlantTFDB-all_TF_pep.fas  -dbtype prot -title PlantTFDB-all_TF_pep.fas#提取基因列表对应的蛋白序列:python $scriptdir/get_fa_by_id.py  -i ../7.all_enrich/gene.list \  -f ../7.all_enrich/pep.fa -p query#转录因子blastp注释blastp -query query.fa -db Ath_pep.fas  -max_hsps 1  \  -num_alignments 1 -evalue 1e-5 -num_threads 2   \  -outfmt "6 qseqid sseqid qlen slen pident length  mismatch gapopen qstart qend sstart send evalue bitscore qcovs stitle"\  -out tf.blast.out

以上就是"blast如何批量注释输出结果指定需要的列信息"这篇文章的所有内容,感谢各位的阅读!相信大家阅读完这篇文章都有很大的收获,小编每天都会为大家更新不同的知识,如果还想学习更多的知识,请关注行业资讯频道。

注释 知识 篇文章 信息 结果 输出 内容 不同 很大 因子 基因 大部分 就是 序列 更多 知识点 蛋白 行业 资讯 资讯频道 数据库的安全要保护哪些东西 数据库安全各自的含义是什么 生产安全数据库录入 数据库的安全性及管理 数据库安全策略包含哪些 海淀数据库安全审计系统 建立农村房屋安全信息数据库 易用的数据库客户端支持安全管理 连接数据库失败ssl安全错误 数据库的锁怎样保障安全 互联网科技工作委员会 互联网下的科技发展 远信互联网科技 科技互联网公司logo 广州凡科互联网科技 亿人帮互联网科技 互联网科技咨询 中国最先进互联网科技公司 成都玖崟互联网科技有限公司乐商圈怎么样 中国互联网有什么科技含量 佳云科技和互联网广告 河南猎农互联网科技有限公司 怎样加入科技互联网 黑科技 体验场景 互联网大会 互联网第三次科技革命特征 互联网科技资金流入 数字互联网科技有限公司 科技互联网专业务虚会材料 重庆科技产业互联网有哪些 中国主要互联网科技公司 广州大一互联网络科技有限公司 互联网科技的发展 互联网科技教育视频 杭州披云加互联网科技有限公司 宇信科技在杭州互联网排第几 广州燕处互联网科技有限公司 信承诺互联网科技有限公司 张家口科技产业互联网平台 安徽九吞吴互联网科技有限公司 六子台科技互联网展会
0