如何采用biopython计算蛋白质的等电点

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采用biopython 计算蛋白质的等电点

最近在做一些蛋白质组的项目，项目中需要计算蛋白质的等电点。网络上有很多网站能提供相应计算服务，但是都是针对单条蛋白质序列进行计算，而我需要计算蛋白质组中所有蛋白序列的等电点。采用Bioython中的几个函数进行计算，代码如下：

from Bio.SeqUtils.ProtParam import ProteinAnalysisfrom Bio import SeqIO# 指定蛋白序列的fasta文件protein_file = "protein.fasta"# 遍历每一条蛋白序列，计算等电点for seq_record in SeqIO.parse(protein_file, "fasta"):    p = ProteinAnalysis(str(seq_record.seq))    # 等电点的计算函数是：isoelectric_point    print(seq_record.id + '\t' + str(p.isoelectric_point()))

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