Perl如何提取染色体序列指定范围的基因序列

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Perl提取指定位置的基因序列用到 substr 函数，用法：

$gene = substr( $fasta,$start-1, $end - $start+1);

其中$fasta是总的序列；$start是提取序列的开始位置，由于Perl字符串是从0计数的，所以要减1；$end是提取序列的结束位置；$gene是提取的指定位置的序列。

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