linux下perl及bioperl怎么安装

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linux下perl及bioperl安装

perl安装

下载地址：http://www.perl.org/get.html

安装：

tar zxvf perl-5.26.1.tar.gzcd perl-5.26.1/./Configure -de -Dprefix=/opt/perl5   #目的安装目录makemake testmake install

测试：

perl -v

有perl的信息即安装成功。

bioperl安装

perl版本要求高于5.6.1

perl -MCPAN -e shellcpan>install Module::Buildcpan>o conf prefer_installer MBcpan>o conf commitcpan>d /bioperl/Distribution    CDRAUG/Dist-Zilla-PluginBundle-BioPerl-0.27.tar.gzDistribution    CJFIELDS/BioPerl-1.007002.tar.gzDistribution    CJFIELDS/BioPerl-1.6.924.tar.gzDistribution    CJFIELDS/BioPerl-DB-1.006900.tar.gzDistribution    CJFIELDS/BioPerl-Network-1.006902.tar.gzDistribution    CJFIELDS/BioPerl-Run-1.007002.tar.gzDistribution    CJFIELDS/Bundle-BioPerl-2.1.9.tar.gz8 items foundcpan>install CJFIELDS/BioPerl-1.6.924.tar.gz

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