R语言方差分解实例分析

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方差分解分析（Variance Partitioning Analysis）

确定最佳环境因子组合之后，进行分解分析，

#P+Hb+eGFRvpa <- varpart(otu, env['P'], env[c('Hb')],env[c('eGFR')],chisquare = FALSE)vpaplot(vpa, digits = 2, Xnames = c('P', 'Hb',"eGFR"), bg = c('blue', 'red',"orange"))

参数 chisquare = TRUE，执行 CCA 的变差分解；默认情况下 chisquare = FALSE，即执行 RDA 的变差分解

注：如果 varpart() 不支持 CCA，请更新 R 版本（如 R3.6 的 vegan）

分成两组（DOC 为一组，AP 和 AK为另一组）环境变量

cca_vp <- varpart(otu, env['DOC'], env[c('AP', 'AK')], chisquare = TRUE)

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