如何理解IMGT和HLA数据库
这期内容当中小编将会给大家带来有关如何理解IMGT和HLA数据库，文章内容丰富且以专业的角度为大家分析和叙述，阅读完这篇文章希望大家可以有所收获。
IMGT/HLA 数据库收录了HLA不同Allel 的序列信息，网址如下
https://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/
最近更新日期为2018年7月11号，版本为3.33.0, 数据库中收录的信息如下
1. 数据概览
数据库中主要收录了HLA I 型和II 型基因的Allel信息，此外，还包含了一些非HLA基因的Allel
2. HLA I 型
对于HLA-I 型基因，包含了经典的HLA-A, HLA-B, HLA-C 等基因，此外，还有部分假基因
3. HLA II 型
HLA II 型基因主要包含了DR, DQ, DP, DO, DM系列基因
4. 其他基因
包含了HFE, MICA, MICB, TAP1, TAP2这几个基因
对于不同的Allel, 除了WHO委员会指定的标准命名外，还提供了一个HLA编号，示意图如下
在如下链接中，可以查看每个allel的详细情况
https://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/docs/version_r3330.html
带下划线的都是超链接，可以点击查看详细情况。以A*01:01:01:14为例，详细信息如下
该数据库还提供了FTP服务，用于下载不同Allel的基因或者蛋白序列,链接如下
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/ipd/imgt/hla/
在FTP中，提供了fasta, msf, pir等多种格式，通常下载fasta就可以了，同时提供了dna, rna, protein 3个不同水平的序列
上述就是小编为大家分享的如何理解IMGT和HLA数据库了，如果刚好有类似的疑惑，不妨参照上述分析进行理解。如果想知道更多相关知识，欢迎关注行业资讯频道。
