LncMAP数据库有什么用

这篇文章主要介绍了LncMAP数据库有什么用，具有一定借鉴价值，感兴趣的朋友可以参考下，希望大家阅读完这篇文章之后大有收获，下面让小编带着大家一起了解一下。

转录调控对疾病的影响是研究的热点之一，除了研究转录因子和TF之间这种直接的调控作用，科学家发发现lncRNA也可以参与转录调控，通过lncRNA-TF-gene的调控网络。
LncMAP数据库收集整理了20多种肿瘤中相关的lncRNA-TF-gene调控网络信息，网址如下

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncMAP/index.jsp

肿瘤类型和对应的lncRNA调控网络数量统计图示如下

通过LncRNA-TF-Gene Tripet可以检索对应的调控网络，检索框如下所示

选择肿瘤类型，然后输入lncRNA, TF, Target gene中的任意一个都可以，以PVT1这个lncRNA为例，检索结果如下

每一行代表一个lncRNA-TF-gene三角关系对，点击Network按钮，可以查看对应的网络图，示意如下

点击more按钮，可以查看详细信息，包括lncRNA，TF, gene在肿瘤患者和正常人中的表达量

与之类似的，还提供了Drug-lncRNA, TF-gene之间的相互作用网络，通过对应的导航栏都可以方便的查找结果，展示形式和上面的lnRNA-TF-gene基本相同。

数据库中的信息是开发团队基于TCGA数据库中的转录组表达谱数据分析得到的，通过在线服务，我们可以方便的查看所有的lncRNA-TF-Gene调控网络结果。

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