R语言中聚类函数的应用有哪些

本篇内容介绍了"R语言中聚类函数的应用有哪些"的有关知识，在实际案例的操作过程中，不少人都会遇到这样的困境，接下来就让小编带领大家学习一下如何处理这些情况吧！希望大家仔细阅读，能够学有所成！

系统聚类Hierarchical clustering（层次聚类、谱系聚类）- 最短距离法（single linkage)- 最长距离法 （complete linkage)- 中间距离法 （median method)- 可变距离法 （flexible median)- 重心

系统聚类Hierarchical clustering（层次聚类、谱系聚类）
- 最短距离法（single linkage)
- 最长距离法 （complete linkage)
- 中间距离法 （median method)
- 可变距离法 （flexible median)
- 重心法 （centroid)
- 类平均法 （average)
- 可变类平均法 （flexible average)
- Ward 最小方差法 （Ward's minimum variance)

在生信行业中，经常会利用到上述聚类方法，对生物数据进行聚类分析，例如R 中常见的相关聚类函数的应用：hclust()参数method:

"single" 最短距离法
"complete" 最长距离法
"median" 中间距离法(=WPGMC）
"average" 类平均法（=UPGMA)
"centroid" 重心法（=UPGMC)
"ward" 离差平方和
"Mcquitty" 相似分析法 (=WPGMA)

需要注意，实际不同语言或不同函数具体的层次聚类方法或有差异，需多加探索。

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