sankey_plot.r如何绘制桑基图

这篇文章将为大家详细讲解有关sankey_plot.r如何绘制桑基图，小编觉得挺实用的，因此分享给大家做个参考，希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获。

绘制桑基图（冲击图）

使用方法:

usage: script/sankey_plot.r [-h] -i input -g group [group ...] -c color                            [-o outdir] [-p prefix] [-H height] [-W width]Sankey plot drawingoptional arguments:  -h, --help            show this help message and exit  -i input, --input input                        input the matrix [required]  -g group [group ...], --group group [group ...]                        input column names of three groups [required]  -c color, --color color                        column to fill color [required]  -o outdir, --outdir outdir                        output file directory [default cwd]  -p prefix, --prefix prefix                        out file name prefix [default result]  -H height, --height height                        the height of pic inches [default 5]  -W width, --width width                        the width of pic inches [default 5]

参数说明：

-i 包含具有对应关系的数据

-g 输入所要绘制桑基图的三列数据的列名

-c 决定分流所填充颜色的列名

使用举例：

Rscript script/sankey_plot.r -i /share/nas1/fangs/test/m6A/TCGA-KIRC/06.m6a_score/metadata_group.tsv -g m6acluster Immune_Subtype group -c m6acluster -p demo

关于"sankey_plot.r如何绘制桑基图"这篇文章就分享到这里了，希望以上内容可以对大家有一定的帮助，使各位可以学到更多知识，如果觉得文章不错，请把它分享出去让更多的人看到。