在线工具TIMER如何使用

这篇文章给大家介绍在线工具TIMER如何使用，内容非常详细，感兴趣的小伙伴们可以参考借鉴，希望对大家能有所帮助。

在线工具TIMER功能及使用

TIMER是用于肿瘤浸润性免疫细胞综合分析的在线工具，通过TIMER算法估计六种免疫浸润细胞（B细胞，CD4+T细胞，CD8+T细胞，中性粒细胞，巨噬细胞和树突状细胞）的丰度，其中：

Gene 模块探索基因表达 与免疫浸润丰度之间的相关性 ；

选择癌症类型，免疫细胞类型，输入基因symbol之后就可以进行分析。

Survival 模块探索临床结果 与免疫浸润或基因表达丰度之间的关联 ；

Mutation 模块探索突变基因 与免疫浸润丰度之间的相关性 ；

SCNA 模块探索基因拷贝变异数与免疫浸润丰度之间相关性 ；

Diff Exp 模块探索 肿瘤与正常组织之间的差异基因表达；

Correlation 模块探索 基因之间的相关性 ；

Estimation 模块通过 TIMER 算法运行用户的私有样本。

关于在线工具TIMER如何使用就分享到这里了，希望以上内容可以对大家有一定的帮助，可以学到更多知识。如果觉得文章不错，可以把它分享出去让更多的人看到。