linux操作命令举例分析

tar -xf GSE58831_RAW.tar

for i in $(ls *.gz); do bgzip -d $i;done

有人提问批量更改fasta序列名称，他的fasta文件格式是

>seq1 | blabla
ATCG
>seq2 | bbbbb
ATCG

他想把序列名称竖线后面的内容都去掉，我自己想到的办法是python，识别大于号开头的行，然后用竖线分割字符串，在写到文件里就可以了，群里一位老师直接给出linux的cut命令

cat pra.fasta | cut -d "|" -f 1

简单明了

-d指定分隔符，-f指定输出分割后的第一列

在linux系统下，管理员安装好的R语言，一些包都放到了指定的位置。每次在我自己的账户下想要调用这些包改如何实现，查到了一种方式是使用.libPaths()

比如R语言启动以后先输入命令

.libPaths(c("/A/B/C"))