R语言的univariate_cox.r怎么使用

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单因素cox回归分析

使用方法：

指定单个变量做cox回归分析，可以是临床数据

$Rscript $scriptdir/univariate_cox.r -husage: /share/nas1/huangls/test/TCGA_immu/scripts/univariate_cox.r       [-h] -i data -t time -e event -v variate [variate ...] [-b blocksize]       [-o outdir] [-p prefix]unvariate cox regressionoptional arguments:  -h, --help            show this help message and exit  -i data, --data data  input data file path[required]  -t time, --time time  set suvival time column name [required]  -e event, --event event                        set event column name must 0 or 1 code format                        [required]  -v variate [variate ...], --variate variate [variate ...]                        variate for cox analysis [required]  -b blocksize, --blocksize blocksize                        Number of variables Parallel to test in each [default                        2]  -o outdir, --outdir outdir                        output file directory [default cwd]  -p prefix, --prefix prefix                        out file name prefix [default cox]

使用举例：

Rscript $scriptdir/univariate_cox.r -i nomogram_metadata.tsv -e EVENT -t TIME \  -v gender  riskScore age_at_index    ajcc_pathologic_stage \  -o univariate_cox \  -p  univariate_cox

参数说明：

-i 输入生存数据与临床数据

结果展示：

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