avereps怎么按照相同ID取均值
发表于:2026-11-02 作者:千家信息网编辑
千家信息网最后更新 2026年11月02日,本篇内容主要讲解"avereps怎么按照相同ID取均值",感兴趣的朋友不妨来看看。本文介绍的方法操作简单快捷,实用性强。下面就让小编来带大家学习"avereps怎么按照相同ID取均值"吧!aggreg
千家信息网最后更新 2026年11月02日avereps怎么按照相同ID取均值
本篇内容主要讲解"avereps怎么按照相同ID取均值",感兴趣的朋友不妨来看看。本文介绍的方法操作简单快捷,实用性强。下面就让小编来带大家学习"avereps怎么按照相同ID取均值"吧!
aggregate可以对数据分组处理
limma包提供一个函数avereps可以对相同ID的数据取均值,识别的输入数据可以是matrix,MAList或者EList,后两者涉及芯片数据标准化过程,此处仅介绍如何针对matrix数据进行处理。
指定数据如下:相同type取均值
> dat type Num1 Num21 A 90 892 B 34 323 C 56 534 D 99 955 E 15 106 A 50 447 B 20 138 C 24 169 D 70 6110 E 14 4
对数据除type列所有数据,按照type分类ID,取均值,结果:
> avereps(dat[,-1],ID=dat$type) Num1 Num2A 70.0 66.5B 27.0 22.5C 40.0 34.5D 84.5 78.0E 14.5 7.0
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